A proposta do INCT POX envolve a investigação de dados epidemiológicos, virológicos, imunopatológicos e clínicos, com alvo na vigilância sorológica e genômica. Estudos de aspectos básicos da biologia, ecoepidemiologia e evolução viral em diferentes biomas e regiões brasileiras, além da patogênese e interações com os hospedeiros. Temos como missão a prevenção e controle das doenças causadas por poxvírus, atuando no desenvolvimento de ferramentas diagnósticas, vacinas e antivirais e pela disseminação de informação .

O INCT POX é composto por pesquisadores de instituições que abrangem todo o território nacional, de norte a sul. Os estudos serão feitos em diferentes biomas como Cerrado, Pantanal, Amazônia e Mata Atlântica e em diferentes regiões geográficas, compreendendo áreas urbanas, rurais e silvestres. Estudos de soroprevalência serão realizados com amostras da região do Cerrado mineiro, das coortes de pacientes infectados com poxvírus e de animais silvestres, rurais e urbanos de diversos biomas e regiões. Os estudos ecoepidemiológicos contemplarão as análises de identificação dos poxvírus circulantes e em conjunto com os estudos de soroprevalência, análises epidemiológicas e da ecologia dos hospedeiros. 

O INCT POX contribuirá para os estudos de ciência básica no ramo da poxvirologia, além de agregar potencial de inovação e desenvolvimento biotecnológico. Novas tecnologias envolvendo vacinas e terapias serão importantes para o setor produtivo do país, além disso, os resultados serão divulgados em publicações científicas e na mídia, preparando o país para o combate a possíveis novas epidemias.